RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 TRDCB7Z8K6 153 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 H7C2Y5 167 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RRASP10301 218 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 GNB3P16520 340 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 VDAC1P21796 283 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ACTBP60709 375 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G7Q13093 441 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ARFRP1Q13795 201 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PLGLAQ15195 96 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TEX38Q6PEX7 206 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD1Q8N668 190 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 Q8N6K4 173 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PHF21AQ96BD5 680 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NABP2Q9BQ15 211 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MED28Q9H204 178 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MCUBQ9NWR8 336 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 COPZ2Q9P299 210 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RNF150Q9ULK6 438 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 LDLRAD4O15165 306 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 HPGDSO60760 199 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IGLL1P15814 213 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RAB6AP20340 208 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 C4BPBP20851 252 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 INPP1P49441 399 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CTAG1AP78358 180 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MXD1Q05195 221 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FCN2Q15485 313 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 LIN54Q6MZP7 749 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM65Q6PI78 240 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TPRA1Q86W33 373 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RITA1Q96K30 269 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZFP57Q9NU63 452 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RDH8Q9NYR8 311 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NBR2O15453 112 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CT45A6P0DMU7 189 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CT45A5P0DMU8 189 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CT45A7P0DMV0 189 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR5H8P0DN80 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ANXA3P12429 323 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CNTFRP26992 372 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MC5RP33032 325 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RAB14P61106 215 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 DHODHQ02127 395 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IL18Q14116 193 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS1Q14954 304 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ARL6IP1Q15041 203 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZPA2 131 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD7Q86VX2 200 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF695Q8IW36 515 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CMTM3Q96MX0 182 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 GINS4Q9BRT9 223 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR51J1Q9H342 316 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PARP11Q9NR21 331 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.55□□□□□ -1.36
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