RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAAP20Q6NZ36 180 aa26.28■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERTAD4Q9NUC0 356 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 DISC1C4P0D8 188 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP3S2P59780 193 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CATR1Q13166 79 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM177Q53S58 311 aa26.27■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC38A6Q8IZM9 456 aa26.26■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TERB2Q8NHR7 220 aa26.26■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf64Q2M2E5 130 aa26.25■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYZL1O95825 349 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 C3orf56Q8N813 242 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2B11Q5JQS5 317 aa26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 WFDC12Q8WWY7 111 aa26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HAX1O00165 279 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHG2P01859 326 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100GP29377 79 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DS2P43631 304 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSG5Q15238 335 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRRT1Q99946 306 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAUP35544 74 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51H1Q8NH63 302 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL15Q9H469 300 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DRB1P01911 266 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 RLN1P04808 185 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 ECI1P42126 302 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP5CP53041 499 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRWD1-AS2P59051 145 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLGLAQ15195 96 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIN54Q6MZP7 749 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35E3Q7Z769 313 aa26.21■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV2-23P01705 113 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGAM2P15259 253 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAK1Q16611 211 aa26.2■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51S1Q8NGJ8 323 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF747Q9BV97 191 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT10AQ9GZT5 417 aa26.2■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A17O43808 307 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIQKQ629K1 86 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPAG16Q8N0X2 631 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHDC1Q8N7A1 406 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 POC5Q8NA72 575 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPB9Q9BQS6 159 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCUBQ9NWR8 336 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 VSIG10L2P0DP72 767 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD300LFQ8TDQ1 290 aa26.19■■□□□ 1.78
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC2A9Q9NRM0 540 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXRED2Q8IWF2 684 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFAND1Q8TCF1 268 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100ZQ8WXG8 99 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 HRASLSQ9HDD0 168 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAMP3O60896 148 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 INPP1P49441 399 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 IDO2Q6ZQW0 420 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARCH1Q8TCQ1 289 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLXNB1O43157 2135 aa26.17■■□□□ 1.78
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR13C8Q8NGS7 320 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01548A6NM66 108 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP4M1O00189 453 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2KP61086 200 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 RND3P61587 244 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D26Q86UD7 250 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R27Q86WC6 154 aa26.15■■□□□ 1.78
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