RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567954.5

LYRM1-208, Transcript of LYR motif containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYRM1, Length 460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM1-208	ENST00000567954	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	MED20	Q9H944	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954		R4GMQ9	66 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ST8SIA5	O15466	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	PSCA	O43653	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	IFNG	P01579	166 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	HBE1	P02100	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SOX2	P48431	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	GSS	P48637	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	HCCS	P53701	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	USH2A	O75445	5202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	CBY3	A6NI87	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954		K7EP13	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	BIRC5	O15392	142 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	DHFR	P00374	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	APOA2	P02652	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OCM2	P0CE71	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	NUDT2	P50583	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	STX3	Q13277	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	MT-ND2	P03891	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SHBG	P04278	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	IFNGR2	P38484	337 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	CAPG	P40121	348 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	GNG11	P61952	73 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SOCS1	O15524	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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