RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	HARBI1	Q96MB7	349 aa		16.85	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		16.85	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	RAMP3	O60896	148 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV2-14	P01704	120 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DQB1	P01920	261 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	RRAS	P10301	218 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	RTL8B	Q17RB0	113 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	IDNK	Q5T6J7	187 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	CNIH2	Q6PI25	160 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		16.84	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	16.83	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG2	P59768	71 aa		16.83	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		16.83	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		16.83	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SHOX	O15266	292 aa		16.82	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	DCUN1D4	Q92564	292 aa		16.82	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOV	Q96L33	236 aa		16.82	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A10	Q96PG2	267 aa		16.82	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		16.82	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0A6YYH2	397 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NJ64	397 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM127	O75204	238 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TUSC2	O75896	110 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CNIH1	O95406	144 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CBX3	Q13185	183 aa		16.81	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01619	G3V211	115 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200		J3QRK9	145 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYZL1	O95825	349 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFBR1	P36897	503 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TPPP2	P59282	170 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2K	P61086	200 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX45	Q8NA69	505 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	POC5	Q8NA72	575 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	YIPF6	Q96EC8	236 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA2	Q9UM82	520 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TENM3	Q9P273	2699 aa		16.8	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WW49	117 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BUA1	57 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	BRI3	O95415	125 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-11	P01762	117 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CD40LG	P29965	261 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	INSL3	P51460	131 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SLURP1	P55000	103 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM68	Q96MH6	324 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	OVOL1	O14753	267 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A5	O76082	557 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV3	P03979	118 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS8	Q16651	343 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	BEST4	Q8NFU0	473 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5T1	Q8NG75	326 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	B9D2	Q9BPU9	175 aa		16.79	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WXM4	84 aa		16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ECI1	P42126	302 aa		16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	HOGA1	Q86XE5	327 aa		16.78	■□□□□ 0.28
PPP4C-205	ENST00000563200	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	AIRE	O43918	545 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFAIP8	O95379	198 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD9	Q7L273	389 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF429	Q86V71	674 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR25	Q96S07	402 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DIABLO	Q9NR28	239 aa		16.77	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		16.76	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	FCGR3B	O75015	233 aa		16.76	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PTHLH	P12272	177 aa		16.76	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	16.76	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	MSGN1	A6NI15	193 aa		16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAPC3	Q92966	411 aa		16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		16.75	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	XRCC3	O43542	346 aa		16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	AADAC	P22760	399 aa		16.74	■□□□□ 0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms