RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	STX3	Q13277	289 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	FCN2	Q15485	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PRSS8	Q16651	343 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MICA	Q29983	383 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ELP2	Q6IA86	826 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TCF24	Q7RTU0	167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MRO	Q9BYG7	248 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	RHOF	Q9HBH0	211 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CACNG5	Q9UF02	275 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617		R4GMQ9	66 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SYT7	O43581	403 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	YPEL1	O60688	119 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NUDT2	P50583	147 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	FXYD7	P58549	80 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPAN31	Q12999	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	C7orf26	Q96N11	449 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	YPEL2	Q96QA6	119 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IL20	Q9NYY1	176 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	JPT1	Q9UK76	154 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617		K7EMT4	169 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB29	O14966	203 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF688	P0C7X2	276 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM225B	P0DP42	221 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	AREG	P15514	252 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	STX1B	P61266	288 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23	1e-7	■■■□□ 16.1
ABCD4-222	ENST00000555617	C6orf183	Q5T699	404 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10K2	Q6IF99	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF773	Q6PK81	442 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PDPN	Q86YL7	162 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MED4	Q9NPJ6	270 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0J9YY99	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2T8	A6NH00	312 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	FXYD1	O00168	92 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	E2F6	O75461	281 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SERPINA3	P01011	423 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MAS1	P04201	325 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PRKACB	P22694	351 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IRF3	Q14653	427 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	KLK9	Q2XQG4	91 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	HARBI1	Q96MB7	349 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	REEP1	Q9H902	201 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0J9YXV3	536 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFA4	O00483	81 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF254	O75437	659 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	GSTT2	P0CG29	244 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	GSTT2B	P0CG30	244 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PLA2G7	Q13093	441 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PP6455	Q8WZ26	134 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SPSB1	Q96BD6	273 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IFT22	Q9H7X7	185 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CMC2	Q9NRP2	79 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PS18	150 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	C15orf62	A8K5M9	175 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	NXPH4	O95158	308 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GNB3	P16520	340 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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