RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 DIABLOQ9NR28 239 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 FCGR3BO75015 233 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 IGLV1-40P01703 118 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 IGLV2-14P01704 120 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 FCGR2CP31995 323 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 RAB9AP51151 201 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 ARL6IP1Q15041 203 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 GPR107Q5VW38 600 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 DDB2Q92466 427 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 ARPC1AQ92747 370 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 SNAPC3Q92966 411 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 GHITMQ9H3K2 345 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TNCP24821 2201 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TAS2R20P59543 309 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 PITPNAQ00169 270 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 RTL8BQ17RB0 113 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 ACTBL2Q562R1 376 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 HOGA1Q86XE5 327 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF152Q8N8N0 203 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 K7EIL1 84 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 HPGDSO60760 199 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 SCGNO76038 276 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 HLA-DQB1P01920 261 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 PMP2P02689 132 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 CRYGBP07316 175 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 OR5H8P0DN80 308 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 SLURP1P55000 103 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TPPP2P59282 170 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TNXAQ16473 311 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 KCTD9Q7L273 389 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 IFT46Q9NQC8 304 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD42-209ENST00000533342 I3L521 148 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 XRCC3O43542 346 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 MYOD1P15172 320 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 RFX2P48378 723 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 CBX3Q13185 183 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM177Q53S58 311 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 SSX9Q7RTT3 188 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM17Q86X19 198 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 VSIG4Q9Y279 399 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A087WW49 117 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 SPDEFO95238 335 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 PRH1P02810 166 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 TRGV3P03979 118 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 CTXN2P0C2S0 81 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 RPA2P15927 270 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 SCAND1P57086 179 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 PHB2Q99623 299 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF5Q99942 180 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 MSGN1A6NI15 193 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 DIRAS3O95661 229 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 ELK1P19419 428 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 DCUN1D4Q92564 292 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD42-209ENST00000533342 PRR25Q96S07 402 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms