RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518381.5

CTNNA1-208, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 487 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-208	ENST00000518381	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RAB27B	O00194	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	NBR2	O15453	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	GABARAP	O95166	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	NDUFB8	O95169	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	PTHLH	P12272	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TPPP2	P59282	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ACTB	P60709	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	LSAMP	Q13449	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SLC31A2	O15432	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	LANCL1	O43813	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	FCER2	P06734	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	CSN3	P07498	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RAB6A	P20340	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RORC	P51449	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	NDP	Q00604	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	NPB	Q8NG41	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381		A0A0G2JLM5	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381		A0A0J9YWU9	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381		H3BMQ9	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	CTDSP2	O14595	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	ORC5	O43913	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	HPGDS	O60760	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-208	ENST00000518381	NDUFA3	O95167	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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