RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2W1Q9Y3N9 320 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETV7Q9Y603 341 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OVOL1O14753 267 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRI3O95415 125 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-DQB1P01920 261 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNG2P59768 71 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PJVKQ0ZLH3 352 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX45Q8NA69 505 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRPEL2Q8TAA5 225 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LGALS14Q8TCE9 139 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MS4A10Q96PG2 267 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL7A1Q02388 2944 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0A6YYH2 397 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM235A6NFC5 223 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A6NJ64 397 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00473A8K010 186 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC2LP0C7M8 214 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECI1P42126 302 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TPPP2P59282 170 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2KP61086 200 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MXD1Q05195 221 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD69Q07108 199 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEDD8Q15843 81 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VMA21Q3ZAQ7 101 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VAX1Q5SQQ9 334 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF167Q9H6Y7 350 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANXA10Q9UJ72 324 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0G2JLM5 398 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSX5O60225 188 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRGV3P03979 118 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IDNKQ5T6J7 187 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POC5Q8NA72 575 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WW49 117 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV3-11P01762 117 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLURP1P55000 103 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5T1Q8NG75 326 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIABLOQ9NR28 239 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SORL1Q92673 2214 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 J3QRK9 145 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUSC2O75896 110 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRYZL1O95825 349 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV2-14P01704 120 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AADACP22760 399 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRSS8Q16651 343 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACSM6Q6P461 480 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OVCH2Q7RTZ1 564 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CROCCP3Q8IVE0 287 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR25Q96S07 402 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA2Q9UM82 520 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSGN1A6NI15 193 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAP30O75446 220 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOGA1Q86XE5 327 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BEST4Q8NFU0 473 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNCP24821 2201 aa12.96□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WXM4 84 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FCGR3BO75015 233 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZP3P21754 424 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK10Q15131 360 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSMO1Q15800 293 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCTD9Q7L273 389 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USMG5Q96IX5 58 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHB2Q99623 299 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBX5P45973 191 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARPC4P59998 168 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL30P62888 115 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.1 ms