RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 RTL8BQ17RB0 113 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 TIGITQ495A1 244 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 TPPP3Q9BW30 176 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM209BQ5JX69 171 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF525Q8N782 197 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 LRTM2Q8N967 370 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 CLDND2Q8NHS1 167 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 POM121Q96HA1 1249 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 H0Y8G0 127 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXF2Q12947 444 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 GCSAMLQ5JQS6 135 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM18Q96B42 140 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 PARLQ9H300 379 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 OR10J4P0C629 311 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 PSG5Q15238 335 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP6V1FQ16864 119 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35E1Q96K37 410 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 METRNQ9UJH8 293 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 MED12LQ86YW9 2145 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 COL6A3P12111 3177 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 CXCL1P09341 107 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SELLP14151 372 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFSF10P50591 281 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 NMSQ5H8A3 153 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 C19orf67A6NJJ6 358 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZT83 130 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SIRT7Q9NRC8 400 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PRD5 423 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PRF3 423 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PRM7 423 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV1-5P01602 117 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 LYL1P12980 280 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL16Q0P5N6 197 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 HES1Q14469 280 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4S2Q8NH73 311 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 NPY1RP25929 384 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 OPRK1P41145 380 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 IL15RAQ13261 267 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SPNS3Q6ZMD2 512 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 GGACTQ9BVM4 153 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM210A6NLX4 147 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 DKK1O94907 266 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 ERVFRD-1P60508 538 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 ERHP84090 104 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SPSB4Q96A44 273 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 TNCP24821 2201 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 CNIH1O95406 144 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 PLAUP00749 431 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 HRASP01112 189 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 BLNKQ8WV28 456 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 ADH4P08319 380 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTDAPP60985 99 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 GABRA6Q16445 453 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 GFRALQ6UXV0 394 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A087X0M5 115 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GX30 115 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 B4DEV8 164 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 MKRN2OSH3BPM6 223 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 FCN1O00602 326 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV3-1P01715 115 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms