RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 BET1O15155 118 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 FABP7O15540 132 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV2-23P01705 113 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 CRYGBP07316 175 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 HSMCR30P0CW71 290 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 BVESQ8NE79 360 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 IL17DQ8TAD2 202 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 CENPOQ9BU64 300 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 OR2D2Q9H210 308 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 MPPED1O15442 326 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 AIREO43918 545 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 OR2A4O95047 310 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 CSN3P07498 182 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM177Q53S58 311 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 IGSF11Q5DX21 431 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 TEX45Q8NA69 505 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 RAB3CQ96E17 227 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 RAB22AQ9UL26 194 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.16□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 ACTL6BO94805 426 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 DIRAS3O95661 229 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 OR9G9P0C7N8 305 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 GSTT2P0CG29 244 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 GSTT2BP0CG30 244 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 APELAP0DMC3 54 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 GADD45AP24522 165 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 TALDO1P37837 337 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 CLDN12P56749 244 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 ATP5G2Q06055 141 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 DYRK1AQ13627 763 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 TNXAQ16473 311 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 GFI1Q99684 422 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 GINS4Q9BRT9 223 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 V9GY05 133 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 RYR2Q92736 4967 aa9.15□□□□□ -0.94
CNOT4-211ENST00000498534 LYSTQ99698 3801 aa9.15□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.15□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SHISA3A0PJX4 238 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FAM223BA6NKX1 122 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TUSC2O75896 110 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 JTBO76095 146 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TPPPO94811 219 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV12-3P01733 135 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2KP61086 200 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 IRF3Q14653 427 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 PRSS8Q16651 343 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SPIN2AQ99865 258 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.14□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CRYZL1O95825 349 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FCGR3AP08637 254 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 RHOGP84095 191 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DEFA5Q01523 94 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ARFRP1Q13795 201 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FAM209BQ5JX69 171 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 HES5Q5TA89 166 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 LAX1Q8IWV1 398 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 A0A075B6Q4 140 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 PDCD5O14737 125 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms