RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR6C6	A6NF89	314 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NEMF	O60524	1076 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SCN2B	O60939	215 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	MT-CO2	P00403	227 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	IFNGR2	P38484	337 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TBPL1	P62380	186 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	FABP5	Q01469	135 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	FAM201A	Q5SY85	155 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR10K2	Q6IF99	312 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268		A0A087WUU8	490 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	C5orf49	A4QMS7	147 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	IQCF5	A8MTL0	148 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	FAM25E	A8MYX2	175 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	ZNF737	O75373	536 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	NPPA	P01160	153 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	C1QC	P02747	245 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	FXYD7	P58549	80 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SNAP25	P60880	206 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	HLA-DRB3	P79483	266 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	HOXC5	Q00444	222 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SLC36A2	Q495M3	483 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TMEM42	Q69YG0	159 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SPATA24	Q86W54	205 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	ZNF675	Q8TD23	568 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SLC7A6	Q92536	515 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	DOHH	Q9BU89	302 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	VCX3B	Q9H321	246 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CST9L	Q9H4G1	147 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CD300A	Q9UGN4	299 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PP64	1363 aa		0.77	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	RTTN	Q86VV8	2226 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TMEM213	A2RRL7	107 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	ATP8B1	O43520	1251 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CRP	P02741	224 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	IL6	P05231	212 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	UGT2B7	P16662	529 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CA5A	P35218	305 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CD79B	P40259	229 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TAS2R20	P59543	309 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	AP1S1	P61966	158 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	NAA40	Q86UY6	237 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CD302	Q8IX05	232 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268		Q96M85	177 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	IMMP2L	Q96T52	175 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	DERL2	Q9GZP9	239 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SLC22A4	Q9H015	551 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	PTPRB	P23467	1997 aa		0.76	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	HMSD	A8MTL9	139 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268		C9JCJ5	164 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268		H3BT86	120 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	HPGDS	O60760	199 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	GPX2	P18283	190 aa		0.75	□□□□□ -2.29
USP34-222	ENST00000498268	SLCO1A2	P46721	670 aa		0.75	□□□□□ -2.29

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