RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A0U1RQK1 487 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM212A6NML5 194 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 RNF212BA8MTL3 300 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 H0YJX3 145 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 K7N7A8 449 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 NDUFA2O43678 99 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TCF21O43680 179 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SULT1B1O43704 296 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPX5O75715 221 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CDK1P06493 297 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 HNF1AP20823 631 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PCMT1P22061 227 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CRHBPP24387 322 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 DCKP27707 260 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR3A1P47881 315 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR3A4PP47883 348 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 POU3F4P49335 361 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP5CP53041 499 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARF6P62330 175 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC58Q4VC31 144 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ASCL4Q6XD76 172 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC51BQ86UW2 128 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF573Q86YE8 665 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q8NFD4 153 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 NANPQ8TBE9 248 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PP6455Q8WZ26 134 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 C10orf35Q96D05 121 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 BORCS8Q96FH0 119 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 COQ2Q96H96 371 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM80Q96HE8 168 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CEP19Q96LK0 163 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q96MT0 163 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OPALINQ96PE5 141 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 DERL3Q96Q80 235 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 HMG20AQ9NP66 347 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 RASL12Q9NYN1 266 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A0B4J203 849 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A1W2PRD5 423 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A1W2PRF3 423 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A1W2PRM7 423 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM89A2RUT3 159 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SNTNA6NMZ2 147 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 C17orf98A8MV24 154 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ODF3BA8MYP8 253 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SIRPB1O00241 398 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 NDUFB3O43676 98 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CDRT1O95170 752 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2H2O95918 312 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 HAND1O96004 215 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV1-69P01742 117 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 GSTT2P0CG29 244 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 GSTT2BP0CG30 244 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CGB3P0DN86 165 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CGB7P0DN87 165 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CD37P11049 281 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTRB1P17538 263 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRKACAP17612 351 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRDX2P32119 198 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAP2K4P45985 399 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 IER3P46695 156 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 GABRA2P47869 451 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATP1B3P54709 279 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 KISS1Q15726 138 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SSX1Q16384 188 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TAF9Q16594 264 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PIGYQ3MUY2 71 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms