RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-DMAP28067 261 aa13.25□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 CFHR3Q02985 330 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTBL2Q562R1 376 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD9Q7L273 389 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52I2Q8NH67 350 aa13.25□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 HARBI1Q96MB7 349 aa13.25□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A17O43808 307 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 CRYZL1O95825 349 aa13.24□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 HERV-K104P61576 105 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.24□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF152Q8N8N0 203 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX45Q8NA69 505 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4F17Q8NGA8 305 aa13.24□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR4F4Q96R69 305 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 KLK11Q9UBX7 282 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 A3GALT2U3KPV4 340 aa13.24□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 TBPP20226 339 aa13.23□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa13.22□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFA13Q9P0J0 144 aa13.22□□□□□ -0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 G3V318 75 aa13.2□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 FXYD3Q14802 87 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 ARRDC1Q8N5I2 433 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM4Q8WVI0 70 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO7Q9Y3I1 522 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.2□□□□□ -0.3
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