RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 CTXN2P0C2S0 81 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 AADACP22760 399 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 DTYMKP23919 212 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 C22orf42Q6IC83 251 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZS49 121 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 PHB2Q99623 299 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SHISA3A0PJX4 238 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SCGNO76038 276 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 BRI3O95415 125 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 CRYGBP07316 175 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 TATDN3Q17R31 274 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 TEX45Q8NA69 505 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 USMG5Q96IX5 58 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 Q9H521 79 aa11.66□□□□□ -0.54
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HERC3-206ENST00000431413 A0A0B4J203 849 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 NOTOA8MTQ0 251 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SLC22A5O76082 557 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 ACTL6BO94805 426 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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HERC3-206ENST00000431413 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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HERC3-206ENST00000431413 CDNFQ49AH0 187 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 TPRA1Q86W33 373 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 FCGR1BQ92637 280 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-206ENST00000431413 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 C3orf84H3BNL1 204 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 MPPED1O15442 326 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 CRYZL1O95825 349 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 CD36P16671 472 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 PSMB9P28065 219 aa11.64□□□□□ -0.55
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HERC3-206ENST00000431413 HACD4Q5VWC8 232 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 ZMAT4Q9H898 229 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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HERC3-206ENST00000431413 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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HERC3-206ENST00000431413 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC3-206ENST00000431413 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 DDB2Q92466 427 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 C5orf30Q96GV9 206 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 RCHY1Q96PM5 261 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 LINC00473A8K010 186 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 OR9G9P0C7N8 305 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 GNG2P59768 71 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 CNIH2Q6PI25 160 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 KCTD9Q7L273 389 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SPARTQ8N0X7 666 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SNAPC3Q92966 411 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SPIN2AQ99865 258 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 SMIM30A4D0T7 59 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 J3QRK9 145 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 FCGR3BO75015 233 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 HLA-DQB1P01920 261 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 APELAP0DMC3 54 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 CDK10Q15131 360 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 RPEL1Q2QD12 228 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 MMD2Q8IY49 270 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-206ENST00000431413 TMEM235A6NFC5 223 aa11.6□□□□□ -0.55
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