RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416606.1

TFAP2C-202, Transcript of transcription factor AP-2 gamma, humanhuman

TSL 3

Gene TFAP2C, Length 482 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2C-202ENST00000416606 USMG5Q96IX5 58 aa14.73□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 COL7A1Q02388 2944 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 SHISA3A0PJX4 238 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 SLURP1P55000 103 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 SCAND1P57086 179 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 C22orf42Q6IC83 251 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 MS4A10Q96PG2 267 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.72□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 LINC00205P59089 165 aa14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 UBE2KP61086 200 aa14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 PLA2G7Q13093 441 aa14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 FAM209BQ5JX69 171 aa14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 HACD4Q5VWC8 232 aa14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 DDB2Q92466 427 aa14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 STUB1Q9UNE7 303 aa14.71□□□□□ -0.05
TFAP2C-202ENST00000416606 A0A075B6Q4 140 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 TMEM127O75204 238 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 IGHV3-11P01762 117 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 GP9P14770 177 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 TATDN3Q17R31 274 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 BVESQ8NE79 360 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SSR3Q9UNL2 185 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.7□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SPNP16150 400 aa14.69□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 CD36P16671 472 aa14.69□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 CDNFQ49AH0 187 aa14.69□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SPARTQ8N0X7 666 aa14.69□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.69□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.69□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 CNIH2Q6PI25 160 aa14.68□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 OR5T1Q8NG75 326 aa14.68□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 TENM3Q9P273 2699 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 C3orf84H3BNL1 204 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ACTL6BO94805 426 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 IGLV1-51P01701 117 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 HLA-DQB1P01920 261 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 PSMB9P28065 219 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 PRSS8Q16651 343 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SPIN2AQ99865 258 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 TNCP24821 2201 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 A0A0A6YYH2 397 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 A6NJ64 397 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 A8MZ25 164 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 H0Y980 276 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 CRYZL1O95825 349 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 OR9G9P0C7N8 305 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 CDK10Q15131 360 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 MMD2Q8IY49 270 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 PHB2Q99623 299 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.66□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 MSGN1A6NI15 193 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 FAM223BA6NKX1 122 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 LINC00473A8K010 186 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 GNG2P59768 71 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 MSMO1Q15800 293 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 SNAPC3Q92966 411 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 C5orf30Q96GV9 206 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ZMAT4Q9H898 229 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 COA4Q9NYJ1 87 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 ETV7Q9Y603 341 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2C-202ENST00000416606 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2C-202ENST00000416606 A0A0B4J203 849 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2C-202ENST00000416606 TNXAQ16473 311 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2C-202ENST00000416606 KCTD9Q7L273 389 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2C-202ENST00000416606 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TFAP2C-202ENST00000416606 ASCL2Q99929 193 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2C-202ENST00000416606 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2C-202ENST00000416606 MPPED1O15442 326 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms