RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 VSIG4Q9Y279 399 aa13.6□□□□□ -0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 CD8AP01732 235 aa13.59□□□□□ -0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.59□□□□□ -0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.59□□□□□ -0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 ZNF616Q08AN1 781 aa13.59□□□□□ -0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.59□□□□□ -0.23
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHA2Q9HB19 425 aa13.59□□□□□ -0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 PGAM2P15259 253 aa13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 EDDM3AQ14507 147 aa13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 FAM90A1Q86YD7 464 aa13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 Q8WTZ3 238 aa13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 SNX22Q96L94 193 aa13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 29.4
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CHTF18-202ENST00000317063 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TP53RKQ96S44 253 aa13.58□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF286AQ9HBT8 521 aa13.58□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.57□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 PRRT1Q99946 306 aa13.57□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.57□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 TENM4Q6N022 2769 aa13.57□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 UMAD1C9J7I0 102 aa13.57□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 TNFRSF1AP19438 455 aa13.57□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 CFHR2P36980 270 aa13.57□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TAS2R46P59540 309 aa13.57□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 VAX1Q5SQQ9 334 aa13.57□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 CCL13Q99616 98 aa13.57□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.57□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 ARID1AO14497 2285 aa13.57□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 FCGR2CP31995 323 aa13.56□□□□□ -0.24
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CHTF18-202ENST00000317063 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.56□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 SLC2A8Q9NY64 477 aa13.56□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 MED13LQ71F56 2210 aa13.56□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 LMO1P25800 156 aa13.56□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 VAMP2P63027 116 aa13.56□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TOMM40LQ969M1 308 aa13.56□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.56□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 CD55P08174 381 aa13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 DOCK11Q5JSL3 2073 aa13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 OR2S2Q9NQN1 319 aa13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 NECAP2Q9NVZ3 263 aa13.55□□□□□ -0.24
CHTF18-202ENST00000317063 A1L4Q6 167 aa13.55□□□□□ -0.24
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