RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.74□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.74□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 I3L521 148 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 XRCC3O43542 346 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 IGLV2-23P01705 113 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 CRYGBP07316 175 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF616Q08AN1 781 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 DEFB136Q30KP8 78 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 TEX45Q8NA69 505 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 LFNGQ8NES3 379 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 BEST4Q8NFU0 473 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 DDB2Q92466 427 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 H3BUA1 57 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 RAMP3O60896 148 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 UBE2KP61086 200 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 MSMO1Q15800 293 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 C5orf30Q96GV9 206 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 GNB4Q9HAV0 340 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 PLXNB1O43157 2135 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 SOX15O60248 233 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 TUSC2O75896 110 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 CRYZL1O95825 349 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-201ENST00000287543 LINC00473A8K010 186 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 J3QRK9 145 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 INSL3P51460 131 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 GNB1P62873 340 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 DGCR2P98153 550 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 KCTD9Q7L273 389 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 CMTM3Q96MX0 182 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.7□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 A0A0G2JLM5 398 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 FCGR3BO75015 233 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 BRI3O95415 125 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 TPPP2P59282 170 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 KRTAP10-11P60412 298 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 POC5Q8NA72 575 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 OR5B12Q96R08 314 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.69□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 LINC01619G3V211 115 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 ACTL6BO94805 426 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 AADACP22760 399 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 FCGR2CP31995 323 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 TGFBR1P36897 503 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 KIR2DS2P43631 304 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 PRSS8Q16651 343 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 OR4S2Q8NH73 311 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 BORCS5Q969J3 196 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 RHOVQ96L33 236 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 IFT46Q9NQC8 304 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.68□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 IGLV2-14P01704 120 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 TRGV3P03979 118 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 CDK10Q15131 360 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 MMD2Q8IY49 270 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 MFSD4AQ8N468 514 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 MS4A10Q96PG2 267 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 PHB2Q99623 299 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 K7EIL1 84 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 PPYP01298 95 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 TAS2R20P59543 309 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-201ENST00000287543 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms