RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RAB9B	Q9NP90	201 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00587	B1AMM8	73 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RAMP3	O60896	148 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	PROP1	O75360	226 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	EPHA1	P21709	976 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00205	P59089	165 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CLDN1	O95832	211 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LPAR6	P43657	344 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	GPR12	P47775	334 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CATR1	Q13166	79 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	TREM1	Q9NP99	234 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00473	A8K010	186 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SLC31A2	O15432	143 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	NDUFB3	O43676	98 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	MMP23A	O75900	390 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280		Q6ZRM9	215 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1B0GU03	582 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	PITX3	O75364	302 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SOD3	P08294	240 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	NFYB	P25208	207 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ID3	Q02535	119 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1W2PPR1	153 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	DVL1	O14640	695 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	NXPH3	O95157	252 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FABP1	P07148	127 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SLC25A6	P12236	298 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1W2PPE3	182 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FAM209B	Q5JX69	171 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	P2RY1	P47900	373 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	LRBA	P50851	2863 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	COLCA2	A8K830	154 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SSSCA1	O60232	199 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FAM157C	P0CG43	387 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SMIM6	P0DI80	62 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CCL3L1	P16619	93 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RAB7A	P51149	207 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM33	P57088	247 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	PEA15	Q15121	130 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31

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