RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567954.5

LYRM1-208, Transcript of LYR motif containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYRM1, Length 460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM1-208	ENST00000567954	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CHEK1	O14757	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	RAB29	O14966	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PRKACB	P22694	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	KDELR2	P33947	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IRF3	Q14653	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	GNMT	Q14749	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	AIP	O00170	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SELENOF	O60613	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	YPEL1	O60688	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF254	O75437	659 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CD5	P06127	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	GPR183	P32249	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	NDUFA4	O00483	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ATP5G1	P05496	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ATF1	P18846	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ATP5G3	P48201	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2B8P	P59922	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ROM1	Q03395	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TNXA	Q16473	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	GGH	Q92820	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954		A0A0J9YXV3	536 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SYT7	O43581	403 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	STX1B	P61266	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	PRSS8	Q16651	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LYRM1-208	ENST00000567954	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms