RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560808.1

NEO1-211, Transcript of neogenin 1, humanhuman

TSL 3

Gene NEO1, Length 1,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1-211ENST00000560808 ISOC1Q96CN7 298 aa7.31□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.31□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 TUBA4BQ9H853 241 aa7.31□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.31□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.31□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 TRDCB7Z8K6 153 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 H3BUA1 57 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 M0R1X1 148 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SPDEFO95238 335 aa7.3□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 VEGFCP49767 419 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 TMEM50BP56557 158 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 HLA-DRB3P79483 266 aa7.3□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 TATDN3Q17R31 274 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 TMEM68Q96MH6 324 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 RDH8Q9NYR8 311 aa7.3□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 MSGN1A6NI15 193 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 IGLV2-23P01705 113 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 IFNA6P05013 189 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 CDK1P06493 297 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 CRYGBP07316 175 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 UCHL1P09936 223 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 AADACP22760 399 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 MED22Q15528 200 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 RAB11BQ15907 218 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 RNLSQ5VYX0 342 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 USMG5Q96IX5 58 aa7.29□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 PECRQ9BY49 303 aa7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SLC17A2O00624 439 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 BET1O15155 118 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SHOXO15266 292 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 BRI3O95415 125 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 TRBV12-3P01733 135 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 CSN3P07498 182 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 CD3GP09693 182 aa7.28□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 BVESQ8NE79 360 aa7.28□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SNAPC3Q92966 411 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.28□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 GFI1Q99684 422 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 SCN3BQ9NY72 215 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 COA4Q9NYJ1 87 aa7.28□□□□□ -1.24
NEO1-211ENST00000560808 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.28□□□□□ -1.24
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NEO1-211ENST00000560808 GSTT2BP0CG30 244 aa7.27□□□□□ -1.25
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NEO1-211ENST00000560808 CLDN12P56749 244 aa7.27□□□□□ -1.25
NEO1-211ENST00000560808 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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NEO1-211ENST00000560808 IGSF11Q5DX21 431 aa7.27□□□□□ -1.25
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NEO1-211ENST00000560808 Q8N402 240 aa7.27□□□□□ -1.25
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NEO1-211ENST00000560808 PHB2Q99623 299 aa7.27□□□□□ -1.25
NEO1-211ENST00000560808 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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