RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 Q9N2K0 584 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 RDH8Q9NYR8 311 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 LCE6AA0A183 80 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 H0Y980 276 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 PROP1O75360 226 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 CDK1P06493 297 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 HSMCR30P0CW71 290 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 APELAP0DMC3 54 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 LGALS7P47929 136 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 SYNJ2BPP57105 145 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 CBX3Q13185 183 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB11BQ15907 218 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 PTX4Q96A99 478 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 TUBA4BQ9H853 241 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 COA4Q9NYJ1 87 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 TRDCB7Z8K6 153 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 H3BUA1 57 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 BET1O15155 118 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 CD3GP09693 182 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 UCHL1P09936 223 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM50BP56557 158 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 CLDN12P56749 244 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 TATDN3Q17R31 274 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 HARBI1Q96MB7 349 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 SPATA25Q9BR10 227 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 PECRQ9BY49 303 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 OR2D2Q9H210 308 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 VCXQ9H320 206 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 SCN3BQ9NY72 215 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 HSF4Q9ULV5 492 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 TENM2Q9NT68 2774 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-205ENST00000549039 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC17A2O00624 439 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 SHOXO15266 292 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 MPPED1O15442 326 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 IFNA6P05013 189 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 AADACP22760 399 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 SERPINB10P48595 397 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 RPEL1Q2QD12 228 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 RNLSQ5VYX0 342 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A075B6Q4 140 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 A8MZ25 164 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 FABP7O15540 132 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 ARL6IP5O75915 188 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 IGLV2-23P01705 113 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 TRBV12-3P01733 135 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 HAGHQ16775 308 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 RTL8BQ17RB0 113 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 IGSF11Q5DX21 431 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 LCN12Q6JVE5 192 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 BVESQ8NE79 360 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM68Q96MH6 324 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 GFI1Q99684 422 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 LYSTQ99698 3801 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0B4J203 849 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 MSGN1A6NI15 193 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 GSTT2P0CG29 244 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 GSTT2BP0CG30 244 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 TNXAQ16473 311 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 HES5Q5TA89 166 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDSP2-205ENST00000549039 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms