RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 MALSU1Q96EH3 234 aa6.3□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 NABP2Q9BQ15 211 aa6.3□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 NUP50Q9UKX7 468 aa6.3□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.3□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 H0YJW9 148 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 M0R1X1 148 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 MPPED1O15442 326 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TXNL1O43396 289 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TNFSF12O43508 249 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 PEX14O75381 377 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 RLN1P04808 185 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 PGAM2P15259 253 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 EPHA1P21709 976 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 F2RP25116 425 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 PAX6P26367 422 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 IL3RAP26951 378 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 CEACAM3P40198 252 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 DYNLT3P51808 116 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 SSX2Q16385 188 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 OR8H3Q8N146 312 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 Q8N6K4 173 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ENKURQ8TC29 256 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 RPEQ96AT9 228 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 GALNT14Q96FL9 552 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TP53RKQ96S44 253 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 S1PR3Q99500 378 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 BEX2Q9BXY8 128 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.29□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 C7orf66A4D0T2 115 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 H0Y980 276 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TIMM23O14925 209 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 RAMP3O60896 148 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 VENTXO95231 258 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 IGKV1-16P04430 117 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 UCP1P25874 307 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 THBS3P49746 956 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R1AQ13522 171 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 EBI3Q14213 229 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 AANATQ16613 207 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF585BQ52M93 769 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 PLET1Q6UQ28 207 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 KCTD9Q7L273 389 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 TEX29Q8N6K0 151 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 NAA60Q9H7X0 242 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.28□□□□□ -1.4
C16orf62-211ENST00000540101 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 C9orf170A2RU37 121 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 SFT2D2O95562 160 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 IGKV1-39P01597 117 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 IGKV1D-39P04432 117 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 IL5P05113 134 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 FBP1P09467 338 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 OR5AC1P0C628 307 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 OR4E1P0C645 316 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 AKR1C4P17516 323 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 SRD5A1P18405 259 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 CD1BP29016 333 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 LGALS4P56470 323 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 RAB25P57735 213 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 TAS2R31P59538 309 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 DHRS2Q13268 280 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM187Q14656 261 aa6.27□□□□□ -1.41
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM16LQ309B1 348 aa6.27□□□□□ -1.41
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