RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 SLC6A1P30531 599 aa14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 BEST4Q8NFU0 473 aa14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 DDB2Q92466 427 aa14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 CMTM3Q96MX0 182 aa14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.92□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 ATP6V0E1O15342 81 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 SPDEFO95238 335 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 OR5H8P0DN80 308 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 PTHLHP12272 177 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 VDAC1P21796 283 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 CBX5P45973 191 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 LGALS7P47929 136 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 THBS3P49746 956 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 CX3CL1P78423 397 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 DEFA6Q01524 100 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.91□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 SLC22A5O76082 557 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 IGLV2-14P01704 120 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 IGLV2-23P01705 113 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 PF4V1P10720 104 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 PSMB8P28062 276 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 TMEM177Q53S58 311 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 PLXNB1O43157 2135 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-209ENST00000485765 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 LINC00473A8K010 186 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 G3V318 75 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 G3V4G9 280 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 IGLV1-40P01703 118 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 CRYGBP07316 175 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 RRASP10301 218 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 RORCP51449 518 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 TAS2R20P59543 309 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 NDPQ00604 133 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 GPR107Q5VW38 600 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 BVESQ8NE79 360 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 SNAPC3Q92966 411 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 PARP11Q9NR21 331 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 APOA1P02647 267 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 ARPC4P59998 168 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 PLGLAQ15195 96 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 C1QL4Q86Z23 238 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 ZNF695Q8IW36 515 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 CCDC160A6NGH7 325 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 J3QRK9 145 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 PF4P02776 101 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 NAT1P18440 290 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 RTL8BQ17RB0 113 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 BATF3Q9NR55 127 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 WIPF1O43516 503 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 SLC25A17O43808 307 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 CD33P20138 364 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 FCGR2CP31995 323 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 MYCNOSP40205 109 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 CBX3Q13185 183 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-209ENST00000485765 MSMO1Q15800 293 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms