RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	PSG5	Q15238	335 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	RNF151	Q2KHN1	245 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	FAM46B	Q96A09	425 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	DERL3	Q96Q80	235 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	CLCC1	Q96S66	551 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A0G2JLM5	398 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096		H3BUA1	57 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC22A1	O15245	554 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	PROP1	O75360	226 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	SPDEF	O95238	335 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	NAPSA	O96009	420 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	CA2	P00918	260 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	IFNA6	P05013	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	CD1A	P06126	327 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	UBB	P0CG47	229 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TAS2R43	P59537	309 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	MED21	Q13503	144 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	POC5	Q8NA72	575 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM80	Q96HE8	168 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		6.54	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TNC	P24821	2201 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	JTB	O76095	146 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	BRI3	O95415	125 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	IGKV1-16	P04430	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	CEL	P19835	753 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	HTR2C	P28335	458 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	FXYD3	Q14802	87 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	OR10K2	Q6IF99	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	OR5T1	Q8NG75	326 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	THRSP	Q92748	146 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	GGH	Q92820	318 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	PTX4	Q96A99	478 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM68	Q96MH6	324 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TM2D1	Q9BX74	207 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	TUBA4B	Q9H853	241 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	LYST	Q99698	3801 aa		6.53	□□□□□ -1.36
UBE2F-222	ENST00000482096	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	DYNC1I1	O14576	645 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	CSN3	P07498	182 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	ZBTB25	P24278	435 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	CEACAM6	P40199	344 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	SYNJ2BP	P57105	145 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00205	P59089	165 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	ST3GAL4	Q11206	333 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	LCN12	Q6JVE5	192 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	PDPN	Q86YL7	162 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096		Q8N402	240 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF383	Q8NA42	475 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	NICN1	Q9BSH3	213 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	TMED9	Q9BVK6	235 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	S100A14	Q9HCY8	104 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
UBE2F-222	ENST00000482096	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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