RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 RAB3BP20337 219 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PSMB9P28065 219 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 RANBP1P43487 201 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 HSPA13P48723 471 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PITPNAQ00169 270 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 DEFA5Q01523 94 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PSG5Q15238 335 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 RNF152Q8N8N0 203 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF383Q8NA42 475 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ARPC1AQ92747 370 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 OR4C12Q96R67 309 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 GHITMQ9H3K2 345 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SCOCQ9UIL1 159 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 HSF4Q9ULV5 492 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SORL1Q92673 2214 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 A0A087WW49 117 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 I3L521 148 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SOX15O60248 233 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA3O95167 84 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 FCGR3AP08637 254 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SSX1Q16384 188 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 RTL8BQ17RB0 113 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 BVESQ8NE79 360 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 HARBI1Q96MB7 349 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 AGMATQ9BSE5 352 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 COA4Q9NYJ1 87 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 U3KQK5 164 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 IFITM5A6NNB3 132 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 LCE2BO14633 110 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TUSC2O75896 110 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 CRYZL1O95825 349 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 FCER2P06734 321 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SPNP16150 400 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINB10P48595 397 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 MXD1Q05195 221 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TNXAQ16473 311 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 CDNFQ49AH0 187 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF429Q86V71 674 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PDPNQ86YL7 162 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 Q9H521 79 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 COL7A1Q02388 2944 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 SHISA3A0PJX4 238 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 MSGN1A6NI15 193 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ITGB1BP1O14713 200 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 PROP1O75360 226 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 ACTL6BO94805 426 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS7P47929 136 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 INSL3P51460 131 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 GNG2P59768 71 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 FHL3Q13643 280 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-209ENST00000480420 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.24□□□□□ -1.41
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