RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 C1QL4Q86Z23 238 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 BVESQ8NE79 360 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 BEST4Q8NFU0 473 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CLCC1Q96S66 551 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF580Q9UK33 172 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V0E1O15342 81 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 GABARAPO95166 117 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PF4P02776 101 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CD33P20138 364 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CBX5P45973 191 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R20P59543 309 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ARPC4P59998 168 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FOXE3Q13461 319 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RNF152Q8N8N0 203 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 DDB2Q92466 427 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CMTM3Q96MX0 182 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PARP11Q9NR21 331 aa7.17□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 LINC00473A8K010 186 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NUDT19A8MXV4 375 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SHOXO15266 292 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A17O43808 307 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TUSC2O75896 110 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SLC22A5O76082 557 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SPDEFO95238 335 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CA2P00918 260 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGLV2-14P01704 120 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGLV2-23P01705 113 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CRYGBP07316 175 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RRASP10301 218 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PSMB8P28062 276 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SLC6A1P30531 599 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FCGR2CP31995 323 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 MYCNOSP40205 109 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 LGALS7P47929 136 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NDPQ00604 133 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CBX3Q13185 183 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RTL8BQ17RB0 113 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TMEM177Q53S58 311 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 GPR141Q7Z602 305 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF695Q8IW36 515 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SNAPC3Q92966 411 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.16□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 WIPF1O43516 503 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 HPGDSO60760 199 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGLV1-40P01703 118 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 APOA1P02647 267 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGLL1P15814 213 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ELK1P19419 428 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 AADACP22760 399 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PRSS3P35030 304 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RAB9AP51151 201 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ECSCRQ19T08 205 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 MZT2AQ6P582 158 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TMEM65Q6PI78 240 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.15□□□□□ -1.26
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