RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444498.5

NME4-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3

Gene NME4, Length 1,111 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-205ENST00000444498 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 SSX5O60225 188 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 SPDEFO95238 335 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 CTXN2P0C2S0 81 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 CX3CL1P78423 397 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 NDPQ00604 133 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 PSG5Q15238 335 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 REC114Q7Z4M0 266 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 SPATA2Q9UM82 520 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NME4-205ENST00000444498 FCN1O00602 326 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 IGLV1-40P01703 118 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TGFBR1P36897 503 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 C5orf30Q96GV9 206 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 CCL24O00175 119 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 CNIH2Q6PI25 160 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 RAX2Q96IS3 184 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 DIABLOQ9NR28 239 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 LGALS7P47929 136 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TMEM65Q6PI78 240 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 KLK15Q9H2R5 256 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 SLC25A17O43808 307 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 RRASP10301 218 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 CBX3Q13185 183 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 RTL8BQ17RB0 113 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 ECSCRQ19T08 205 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 DDB2Q92466 427 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 DUX3Q96PT4 197 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 CLCC1Q96S66 551 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 CA2P00918 260 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 IGLV2-23P01705 113 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 HLA-DQB1P01920 261 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 RAB9AP51151 201 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 DEFB136Q30KP8 78 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TMEM177Q53S58 311 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 BVESQ8NE79 360 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 HARBI1Q96MB7 349 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 A0A1W2PN81 502 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 XRCC3O43542 346 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 SOX15O60248 233 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 SLC22A5O76082 557 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 CRYGBP07316 175 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 CHRNA7P36544 502 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 HOGA1Q86XE5 327 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 BEST4Q8NFU0 473 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 VSIG4Q9Y279 399 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-205ENST00000444498 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 LINC00473A8K010 186 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 J3QRK9 145 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 SHOXO15266 292 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 TUSC2O75896 110 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 RUNX1Q01196 453 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 FHL3Q13643 280 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 FXYD3Q14802 87 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-205ENST00000444498 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms