RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 OR8U9P0C7N5 309 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GNB3P16520 340 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 LGALS7P47929 136 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OR10A3P58181 314 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GNB1P62873 340 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 NDPQ00604 133 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 C22orf42Q6IC83 251 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF429Q86V71 674 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF383Q8NA42 475 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FCGR1BQ92637 280 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ARPC1AQ92747 370 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OR2D2Q9H210 308 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GAB2Q9UQC2 676 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 OVOL1O14753 267 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 IGKV1-16P04430 117 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 RRASP10301 218 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 RTL8BQ17RB0 113 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 LFNGQ8NES3 379 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SCOCQ9UIL1 159 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 RAB27BO00194 218 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 MFNGO00587 321 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SLC25A17O43808 307 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PROP1O75360 226 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SCGNO76038 276 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 LY86O95711 162 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GSTT2P0CG29 244 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GSTT2BP0CG30 244 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PSMB9P28065 219 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TPPP2P59282 170 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PLA2G7Q13093 441 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FXYD3Q14802 87 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 IGSF11Q5DX21 431 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PRR25Q96S07 402 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SOX15O60248 233 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 SAP30O75446 220 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 DCUN1D4Q92564 292 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 HARBI1Q96MB7 349 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM68Q96MH6 324 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 MS4A10Q96PG2 267 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 NOTOA8MTQ0 251 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 SHOXO15266 292 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 ATP6V1G2O95670 118 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 TRGV3P03979 118 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 Q6ZS49 121 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 TPRA1Q86W33 373 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 STUB1Q9UNE7 303 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 SSR3Q9UNL2 185 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 A0A0G2JLM5 398 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 SHISA3A0PJX4 238 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 H3BUA1 57 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 CTXN2P0C2S0 81 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 DTYMKP23919 212 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 LINC00205P59089 165 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 PITPNAQ00169 270 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 SPARTQ8N0X7 666 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 A0A0B4J203 849 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 IGHV3-11P01762 117 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 CDNFQ49AH0 187 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 POC5Q8NA72 575 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 BVESQ8NE79 360 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 OR4C12Q96R67 309 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC78-204ENST00000439619 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms