RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CABLES2Q9BTV7 478 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN12P56749 244 aa16.17■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 TPPP2P59282 170 aa16.17■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 RAB22AQ9UL26 194 aa16.17■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 STAB2Q8WWQ8 2551 aa16.17■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH7Q8WXX0 4024 aa16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FABP7O15540 132 aa16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 RPS16P62249 146 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CLCC1Q96S66 551 aa16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ASCL2Q99929 193 aa16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK7Q9Y2U2 307 aa16.16■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf84H3BNL1 204 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 M0R1X1 148 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A17O43808 307 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 BRI3O95415 125 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FCGR3AP08637 254 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 GP9P14770 177 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SPNP16150 400 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS7P47929 136 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00205P59089 165 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 PITPNAQ00169 270 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FXYD3Q14802 87 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 RAB3CQ96E17 227 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM68Q96MH6 324 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.15■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SORL1Q92673 2214 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV2-23P01705 113 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-11P01762 117 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 CD3GP09693 182 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 POC5Q8NA72 575 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A10Q96PG2 267 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 CENPOQ9BU64 300 aa16.14■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 MFNGO00587 321 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD5O14737 125 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRGV3P03979 118 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 CRYGBP07316 175 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 RAB6AP20340 208 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G7Q13093 441 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 HES5Q5TA89 166 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 OR10J5Q8NHC4 309 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C12Q96R67 309 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 OR2D2Q9H210 308 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.13■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GADD45AP24522 165 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 MAP2K4P45985 399 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 SSX1Q16384 188 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM177Q53S58 311 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF11Q5DX21 431 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZS49 121 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 SBSPONQ8IVN8 264 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 OR10R2Q8NGX6 335 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ELOVL1Q9BW60 279 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 VCX3BQ9H321 246 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.12■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JLM5 398 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IFITM5A6NNB3 132 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 RAB27BO00194 218 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 BET1O15155 118 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 RRASP10301 218 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZP3P21754 424 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GALP22466 123 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 HSPA13P48723 471 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 CBX3Q13185 183 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 HARBI1Q96MB7 349 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 STUB1Q9UNE7 303 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 CNIH1O95406 144 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV1-51P01701 117 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GSTT2P0CG29 244 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GSTT2BP0CG30 244 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 RTL8BQ17RB0 113 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf30Q96GV9 206 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 RCHY1Q96PM5 261 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 SHISA3A0PJX4 238 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GNB3P16520 340 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 MYL9P24844 172 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 OR10A3P58181 314 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ARL6IP1Q15041 203 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 DDB2Q92466 427 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ADTRPQ96IZ2 230 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa16.09■□□□□ 0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa16.08■□□□□ 0.16
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