RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 ARPC1AQ92747 370 aa16.07■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa16.07■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SORL1Q92673 2214 aa16.07■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 FABP7O15540 132 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SAP30O75446 220 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 FCGR3AP08637 254 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 RPS16P62249 146 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SSX1Q16384 188 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 HES5Q5TA89 166 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 RAB3CQ96E17 227 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 RHOVQ96L33 236 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 CLCC1Q96S66 551 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SHISA3A0PJX4 238 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 M0R1X1 148 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 MFNGO00587 321 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 CD3GP09693 182 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 TPPP2P59282 170 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 VCX3BQ9H321 246 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 DNAH7Q8WXX0 4024 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 ERICH4A6NGS2 130 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 IFITM5A6NNB3 132 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 H3BUA1 57 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 RAB27BO00194 218 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 PDCD5O14737 125 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SLC25A17O43808 307 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 LY86O95711 162 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 IGLV2-23P01705 113 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 CRYGBP07316 175 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 OR8U9P0C7N5 309 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 RAB6AP20340 208 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 CD40LGP29965 261 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 HSPA13P48723 471 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 IGSF11Q5DX21 431 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 OR10R2Q8NGX6 335 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 OR2D2Q9H210 308 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.04■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 IGHV3-11P01762 117 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 LGALS7P47929 136 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 OR10A3P58181 314 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 FXYD3Q14802 87 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 POC5Q8NA72 575 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 C5orf30Q96GV9 206 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 MS4A10Q96PG2 267 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 BET1O15155 118 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 BRI3O95415 125 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 GSTT2P0CG29 244 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 GSTT2BP0CG30 244 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SPNP16150 400 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 GALP22466 123 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 GADD45AP24522 165 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 Q6ZS49 121 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 OR10J5Q8NHC4 309 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 ASCL2Q99929 193 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN4-204ENST00000426921 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 TRGV3P03979 118 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 GP9P14770 177 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 GNB3P16520 340 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 PITPNAQ00169 270 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM177Q53S58 311 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 HARBI1Q96MB7 349 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM68Q96MH6 324 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 MYL9P24844 172 aa16■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 PJVKQ0ZLH3 352 aa16■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 CNBD2Q96M20 576 aa16■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 CENPOQ9BU64 300 aa16■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 RAB3BP20337 219 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 DDB2Q92466 427 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 A0A0G2JLM5 398 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 METTL21EPA6NDL7 271 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 CNIH1O95406 144 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 RRASP10301 218 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 ZP3P21754 424 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 CBX3Q13185 183 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 ARL6IP1Q15041 203 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 RTL8BQ17RB0 113 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN4-204ENST00000426921 SBSPONQ8IVN8 264 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms