RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDB2Q92466 427 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TP53RKQ96S44 253 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHB2Q99623 299 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM222Q9H0R3 208 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0B4J2A0 478 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINE2P07093 398 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRASP10301 218 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOSL1P15407 271 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 UCP1P25874 307 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MC5RP33032 325 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 REG1BP48304 166 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGDIBP52566 201 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM187Q14656 261 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC9A3R2Q15599 337 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF383Q8NA42 475 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5AN1Q8NGI8 311 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLYATL2Q8WU03 294 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 NABP2Q9BQ15 211 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51J1Q9H342 316 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHPKQ9UHJ6 478 aa13.71□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS13CQ709C8 3753 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FSHBP01225 129 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOA2P02652 100 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPA2P15927 270 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTL8BQ17RB0 113 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SP6Q3SY56 376 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPAG16Q8N0X2 631 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM56Q96MV1 263 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa13.7□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 H0YJW9 148 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCGR3BO75015 233 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDS2O95674 445 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB13P51153 203 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00205P59089 165 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSX2Q16385 188 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LGI3Q8N145 548 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRTM2Q8N967 370 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4S2Q8NH73 311 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL22RA2Q969J5 263 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 AJUBAQ96IF1 538 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP50Q9UKX7 468 aa13.69□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PPI3 338 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSNA1O43805 119 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD55Q3KP44 614 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF585BQ52M93 769 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRD3OSQ6XYD6 125 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOB3BQ86TA1 216 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDPNQ86YL7 162 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMUB1Q9BVT8 246 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 WASHC3Q9Y3C0 194 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa13.68□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 A8MV72 311 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMM23O14925 209 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAMP3O60896 148 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATG12O94817 140 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 HPRT1P00492 218 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD99P14209 185 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD1BP29016 333 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LPAR6P43657 344 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF695Q8IW36 515 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHA2Q9HB19 425 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM160Q9NX00 188 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 COMMD9Q9P000 198 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GVG6 124 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 DBX1A6NMT0 343 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 H7C2Y5 167 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRS3P32247 399 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 UXS1Q8NBZ7 420 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 C17orf50Q8WW18 174 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 AIFM2Q9BRQ8 373 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MED28Q9H204 178 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 YAE1D1Q9NRH1 226 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAHCC1Q9P281 2608 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0U1RQK1 487 aa13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms