RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 FAM46BQ96A09 425 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPK0 400 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 PRH1P02810 166 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 RHOGP84095 191 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 PHB2Q99623 299 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 PPP5D1E7EU14 171 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 OGG1O15527 345 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 APOA2P02652 100 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 OR9G9P0C7N8 305 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CEACAM6P40199 344 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF45Q02386 682 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ATP5G2Q06055 141 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB135Q30KP9 77 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SETD6Q8TBK2 473 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 LALBAP00709 142 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CBLN1P23435 193 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CAPGP40121 348 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZWC4 215 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM19Q96E16 107 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CKLFQ9UBR5 152 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD12-201ENST00000404162 FAM223BA6NKX1 122 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 OR2C1O95371 312 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 NAPSAO96009 420 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ALPLP05186 524 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 FCGR1AP12314 374 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ETV1P50549 477 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 Q499Y3 187 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 TM4SF20Q53R12 229 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 THRSPQ92748 146 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 MLXQ9UH92 298 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 LGALS9O00182 355 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 TUSC2O75896 110 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 CDH26Q8IXH8 852 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 HARBI1Q96MB7 349 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF221Q9UK13 617 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 M0R1X1 148 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB25P24278 435 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 OR10K2Q6IF99 312 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 PTX4Q96A99 478 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 Q96MT0 163 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 EI24O14681 340 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 MPPED1O15442 326 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 MED14OSP0DP75 135 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 HTR2CP28335 458 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 APOC4P55056 127 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 TNXAQ16473 311 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 RNF183Q96D59 192 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM213A2RRL7 107 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 DYNC1I1O14576 645 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 OR2J3O76001 311 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 SCTP09683 121 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DRB3P79483 266 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 NICN1Q9BSH3 213 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 MUC4Q99102 2169 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GVY2 172 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 SHOXO15266 292 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 PKD1P98161 4303 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXD12-201ENST00000404162 C15orf32Q32M92 178 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms