RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASL11BQ9BPW5 248 aa12.16□□□□□ -0.46
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.16□□□□□ -0.46
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 EHFQ9NZC4 300 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTFP1Q9UDX5 166 aa12.16□□□□□ -0.46
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DMAP28067 261 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RFX2P48378 723 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F2RL1P55085 397 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL18Q14116 193 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6F1Q8NGZ6 308 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35D1Q9NTN3 355 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C5orf64Q2M2E5 130 aa12.12□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FXYD4P59646 89 aa12.11□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM177Q53S58 311 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIN54Q6MZP7 749 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCTD9Q7L273 389 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SGMS2Q8NHU3 365 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00473A8K010 186 aa12.1□□□□□ -0.47
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