RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM127	O75204	238 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBBP9	O75884	186 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIRAS3	O95661	229 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOA2	P02652	100 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TFAP2A	P05549	437 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	DTYMK	P23919	212 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	RITA1	Q96K30	269 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32	7e-7	■■■■■ 41.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.07	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035		H0YJW9	148 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0R1X1	148 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNTFR	P26992	372 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZS49	121 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPB	Q8NG41	125 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF5	Q99942	180 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035		G3V4G9	280 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC6A1	P30531	599 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	CBX3	Q13185	183 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR51J1	Q9H342	316 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.05	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0A6YYH2	397 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035		A6NJ64	397 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	RRH	O14718	337 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	WIPF1	O43516	503 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGF1	P05019	195 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELANE	P08246	267 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.04	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFA3	O95167	84 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXE3	Q13461	319 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.03	□□□□□ -0.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035		J3QRK9	145 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PROP1	O75360	226 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TGFBR1	P36897	503 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	THBS3	P49746	956 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.02	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHG4	P01861	327 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RRAS	P10301	218 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYCNOS	P40205	109 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00205	P59089	165 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARPC4	P59998	168 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.01	□□□□□ -0.33

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