RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BUA1 57 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A17O43808 307 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CNIH1O95406 144 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL12AP19105 171 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DCKP27707 260 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPGP40121 348 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CD81P60033 236 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5AN1Q8NGI8 311 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 APH1BQ8WW43 257 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TNCP24821 2201 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 IZUMO1RA6ND01 250 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LALBAP00709 142 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 RPEL1Q2QD12 228 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 FAAP24Q9BTP7 215 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 CSN3P07498 182 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH26Q8IXH8 852 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SVOPQ8N4V2 548 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BNX3 289 aa20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 RNLSQ5VYX0 342 aa20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 COA4Q9NYJ1 87 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PEMTQ9UBM1 199 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 EDARADDQ8WWZ3 215 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC29A1Q99808 456 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCC2Q9BRT2 126 aa20.75■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A8Q9NY64 477 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1A1Q9P1Q5 309 aa20.75■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR10K2Q6IF99 312 aa20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 MOB1BQ7L9L4 216 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PDPNQ86YL7 162 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB125Q8N687 156 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2K2Q8NGT1 345 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00476Q8WZB0 136 aa20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR2A4O95047 310 aa20.73■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00205P59089 165 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PHB2Q99623 299 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.72■□□□□ 0.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CD7P09564 240 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 UBBP0CG47 229 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 APELAP0DMC3 54 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB25P24278 435 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PJVKQ0ZLH3 352 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAPC3Q92966 411 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 USMG5Q96IX5 58 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM68Q96MH6 324 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC10AQ9H1F0 79 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35D1Q9NTN3 355 aa20.71■□□□□ 0.91
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