RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 RAB29O14966 203 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 BRI3O95415 125 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 Q499Y3 187 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF383Q8NA42 475 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 GRPEL2Q8TAA5 225 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 KCNK15Q9H427 330 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SLC23A1Q9UHI7 598 aa10.7□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF785A8K8V0 405 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 H0Y980 276 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 TFAP2AP05549 437 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CD7P09564 240 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 FSTP19883 344 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 EDN2P20800 178 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 HTR2CP28335 458 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 FXYD3Q14802 87 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 DEFB125Q8N687 156 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 POC5Q8NA72 575 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.69□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 OR5H14A6NHG9 310 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SLC25A17O43808 307 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 ZP3P21754 424 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 DCKP27707 260 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 INSL4Q14641 139 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SVOPQ8N4V2 548 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 DERL3Q96Q80 235 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 NICN1Q9BSH3 213 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.68□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 A0A0A6YYD4 124 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 NAPSAO96009 420 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 IGLV2-23P01705 113 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CRYGBP07316 175 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 APELAP0DMC3 54 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 MC5RP33032 325 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CAPGP40121 348 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 YIF1BQ5BJH7 314 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF343Q6P1L6 599 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 RNF5Q99942 180 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CKLFQ9UBR5 152 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 LRRC42Q9Y546 428 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SELENOKQ9Y6D0 94 aa10.67□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SLC22A1O15245 554 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 RBBP9O75884 186 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CD40LGP29965 261 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CEACAM6P40199 344 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CDH26Q8IXH8 852 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SETD6Q8TBK2 473 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.66□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SHISA3A0PJX4 238 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 DYNC1I1O14576 645 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 SCTP09683 121 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CPEP16870 476 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CD81P60033 236 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 UNC119Q13432 240 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 RNLSQ5VYX0 342 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 Q8N402 240 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 NEURL2Q9BR09 285 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 DNAH2Q9P225 4427 aa10.65□□□□□ -0.7
FCHO1-228ENST00000599236 A0A0G2JLM5 398 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 H3BUA1 57 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ITGB1BP1O14713 200 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 SOCS1O15524 211 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 CIB2O75838 187 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 CNIH1O95406 144 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 QRFPP83859 136 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 LCN12Q6JVE5 192 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 BVESQ8NE79 360 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 IL17DQ8TAD2 202 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 GGHQ92820 318 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms