RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB9B	Q9NP90	201 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ZEB1-223	ENST00000561304	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ZEB1-223	ENST00000561304	ZFP57	Q9NU63	452 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ZEB1-223	ENST00000561304	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A0B4J203	849 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CCL24	O00175	119 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	NBR2	O15453	112 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	PROP1	O75360	226 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	NDUFA3	O95167	84 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	IGHG4	P01861	327 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	HLA-DRB1	P01911	266 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	IGF1	P05019	195 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	SCT	P09683	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CT45A6	P0DMU7	189 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CT45A5	P0DMU8	189 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CT45A7	P0DMV0	189 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ARSB	P15848	533 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	PSMB8	P28062	276 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	MYCNOS	P40205	109 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	VEGFC	P49767	419 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB11B	Q15907	218 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	HES5	Q5TA89	166 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	COMMD1	Q8N668	190 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	GNB4	Q9HAV0	340 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304		Q9N2K0	584 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	LYST	Q99698	3801 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	TNC	P24821	2201 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	SMIM30	A4D0T7	59 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304		H0YJW9	148 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	SOX15	O60248	233 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	RGS11	O94810	467 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ELANE	P08246	267 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CD3G	P09693	182 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	VDAC1	P21796	283 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB25	P57735	213 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	GNB1	P62873	340 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	FHL3	Q13643	280 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAM1	Q15629	374 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	NPB	Q8NG41	125 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	OR51J1	Q9H342	316 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	FBXL15	Q9H469	300 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	PARP11	Q9NR21	331 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	RNF150	Q9ULK6	438 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	HSF4	Q9ULV5	492 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	GAB2	Q9UQC2	676 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	FCN1	O00602	326 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB29	O14966	203 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ARL6IP5	O75915	188 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	SCGB1D2	O95969	90 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	IGKV1-16	P04430	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC6A1	P30531	599 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	KIR2DS1	Q14954	304 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ECSCR	Q19T08	205 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF383	Q8NA42	475 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ZEB1-223	ENST00000561304	OR8U1	Q8NH10	309 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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