RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MAST4	O15021	2626 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	HIVEP1	P15822	2718 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	LY6L	H3BQJ8	138 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR31	O00270	319 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CRLF1	O75462	422 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	APOA2	P02652	100 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB13	P51153	203 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	BAMBI	Q13145	260 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CATR1	Q13166	79 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	POC5	Q8NA72	575 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	C17orf50	Q8WW18	174 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ABCA1	O95477	2261 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	TIMM23	O14925	209 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	PLA2G10	O15496	165 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	TNFSF12	O43508	249 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	GNRHR	P30968	328 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MC5R	P33032	325 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	THBS3	P49746	956 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CCR6	P51684	374 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	AANAT	Q16613	207 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	BVES	Q8NE79	360 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	COPZ2	Q9P299	210 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MED13L	Q71F56	2210 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PPI3	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904		H7C2Y5	167 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	NDUFB6	O95139	128 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RLN1	P04808	185 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM106CP	P0CH98	169 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	PIGP	P57054	158 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	HES1	Q14469	280 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	OR5R1	Q8NH85	324 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SSX3	Q99909	188 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ACAN	P16112	2415 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CT45A6	P0DMU7	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CT45A5	P0DMU8	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CT45A7	P0DMV0	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RRAS	P10301	218 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	PI3	P19957	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	PAX6	P26367	422 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC6A1	P30531	599 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DYNLT3	P51808	116 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	IFITM3	Q01628	133 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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