RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC29Q8WV35 223 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CCL19Q99731 98 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NOX4Q9NPH5 578 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CA10Q9NS85 328 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 METRNQ9UJH8 293 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CEP290O15078 2479 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 APC2O95996 2303 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRF3 423 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRM7 423 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 F8WDY8 70 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 M0R135 149 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R45P59539 299 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 LTBQ06643 244 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF799Q96GE5 643 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PARP14Q460N5 1801 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MESP2Q0VG99 397 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TESK1Q15569 626 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 LHX4Q969G2 390 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR4F4Q96R69 305 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 P2RX4Q99571 388 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MGST2Q99735 147 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GU03 582 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SYNGR1O43759 233 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO45P0C2W1 286 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 HBG1P69891 147 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HBG2P69892 147 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PCOLCEQ15113 449 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS8Q16651 343 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00303Q3SY05 128 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 LTBP1Q14766 1721 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRD5 423 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 HPXP02790 462 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZP1P60852 638 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 EFNB1P98172 346 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 EDDM3AQ14507 147 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 TRAV27A0A087WT01 109 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 G3V4G9 280 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF141Q15928 474 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 TNXAQ16473 311 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF585BQ52M93 769 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TM4SF19Q96DZ7 209 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPE3 182 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 UPK1AO00322 258 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SHC1P29353 583 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GPR183P32249 361 aa5.46□□□□□ -1.53
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