RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 SDSLQ96GA7 329 aa7.24□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 SEC11CQ9BY50 192 aa7.24□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PPR1 153 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 C9orf170A2RU37 121 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 A6NNC1 897 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PPIAL4DF5H284 164 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 H0YIZ8 118 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 K7N7A8 449 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 MGST3O14880 152 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TSPAN15O95858 294 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 GYPAP02724 150 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 SOD3P08294 240 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TAS2R31P59538 309 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PAX5Q02548 391 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 EDDM3AQ14507 147 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 ZNF124Q15973 351 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 RNF212Q495C1 297 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PYY3Q5JQD4 70 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TOMM40LQ969M1 308 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 MMP26Q9NRE1 261 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 USF3Q68DE3 2245 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 CD8AP01732 235 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 DANCRP0C864 163 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 RAB5AP20339 215 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 GLIPR1P48060 266 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 FXYD4P59646 89 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 HERV-K104P61576 105 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 RAB32Q13637 225 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PRR18Q8N4B5 295 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 UBALD1Q8TB05 177 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 CCL13Q99616 98 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 DIRAS3O95661 229 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PPYP01298 95 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 ZNF728P0DKX0 622 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 AADACP22760 399 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 GAMTQ14353 236 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 LYG2Q86SG7 212 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 DTX2Q86UW9 622 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 STX12Q86Y82 276 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 MOB3AQ96BX8 217 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 GAFA1Q96PS6 74 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 UMAD1C9J7I0 102 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 AP4M1O00189 453 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 PHOX2AO14813 284 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 ST8SIA5O15466 376 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 FABP4P15090 132 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 HMGN3Q15651 99 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 MIDNQ504T8 468 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 ODAMA1E959 279 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 C12orf77C9JDV5 145 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 UBE2CO00762 179 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 TMPRSS2O15393 492 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 FBP1P09467 338 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 EDDM3BP56851 147 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 LURAP1Q96LR2 239 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 RFNGQ9Y644 331 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-210ENST00000541576 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.22□□□□□ -1.25
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