RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 NPYP01303 97 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CRYBA1P05813 215 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD7P09564 240 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RCVRNP35243 200 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFNGR2P38484 337 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCR2P41597 374 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 STC1P52823 247 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 DAOAP59103 153 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RUNX1Q01196 453 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR11L1Q8NGX0 322 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR6N2Q8NGY6 317 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CIB1Q99828 191 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 KPTNQ9Y664 436 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM64CA6NLI5 447 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 C8orf87E5RJ46 101 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFXANKO14593 260 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITGB1BP1O14713 200 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR13C7P0DN81 318 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANXA8P13928 327 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 GALP22466 123 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDK2P24941 298 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CRYBB3P26998 211 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSMB8P28062 276 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OPRM1P35372 400 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RANBP1P43487 201 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 BCAP31P51572 246 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLDN8P56748 225 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPI1P60174 286 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 FGF12P61328 243 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 AP1S1P61966 158 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBC1D28Q2M2D7 210 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9orf64Q5T6V5 341 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASCL4Q6XD76 172 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 DOLPP1Q86YN1 238 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDCL2Q8N4E4 241 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR1L8Q8NGR8 309 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR13C9Q8NGT0 318 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLDND2Q8NHS1 167 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABHD14BQ96IU4 210 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 PGLYRP3Q96LB9 341 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 MED28Q9H204 178 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAS2R13Q9NYV9 303 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 COL7A1Q02388 2944 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMARCA4P51532 1647 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A0D9SEW6 157 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 GOLGA8IPA6NC78 632 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 MEIS3P1A6NDR6 274 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 MPZL2O60487 215 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 EPPINO95925 133 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPBPP02775 128 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRGC1P0CF51 173 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TUBG1P23258 451 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEKP35659 375 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 UGT2B10P36537 528 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSMB3P49720 205 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAM1Q15629 374 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMCR5Q8TEV8 140 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC00526Q96FQ7 95 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMELYQ99218 206 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 BLZF1Q9H2G9 400 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TUBG2Q9NRH3 451 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 DMAC2Q9NW81 257 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM216Q9P0N5 145 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTPRSQ13332 1948 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 NSD2O96028 1365 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 H7C2G1 150 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKR7A2O43488 359 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFB2O95178 105 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBBP0CG47 229 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFA4P12838 97 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CA5AP35218 305 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 GABRA2P47869 451 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 BTN3A2P78410 334 aa-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms