RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 VSIRQ9H7M9 311 aa6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 C1RLQ9NZP8 487 aa6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CACNG5Q9UF02 275 aa6.33□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 H3BML4 177 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ANGPTL7O43827 346 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ARL4DP49703 201 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 LGALS4P56470 323 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SELENOVP59797 346 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 RAB30Q15771 203 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OR13H1Q8NG92 308 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NABP1Q96AH0 204 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NRN1Q9NPD7 142 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 GPR27Q9NS67 375 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 RFNGQ9Y644 331 aa6.32□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CACNA1CQ13936 2221 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 A0A1B0GX78 115 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OR5B21A6NL26 309 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SYNGR3O43761 229 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NDUFB8O95169 186 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CEACAM3P40198 252 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OPRK1P41145 380 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 AMTP48728 403 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CLDN17P56750 224 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 KRTDAPP60985 99 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CX3CL1P78423 397 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CATR1Q13166 79 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 RTP5Q14D33 572 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 HLA-BQ31612 363 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PIGYQ3MUY2 71 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 RAET1LQ5VY80 246 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PRR27Q6MZM9 219 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 TCF24Q7RTU0 167 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 MUC15Q8N387 334 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 STPG4Q8N801 248 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF611Q8N823 705 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NAT6Q93015 286 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 C11orf52Q96A22 123 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ST20Q9HBF5 79 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OSTCQ9NRP0 149 aa6.31□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 A0A1W2PRS3 328 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CDIPTO14735 213 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ZFAND5O76080 213 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 CLDN1O95832 211 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 HLA-DRB1P01911 266 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SCGB1A1P11684 91 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PMCHP20382 165 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NPY1RP25929 384 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 NOGQ13253 232 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 IGFBP7Q16270 282 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 PCSK4Q6UW60 755 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 LYG1Q8N1E2 194 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.3□□□□□ -1.4
GABPB2-201ENST00000368916 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.3□□□□□ -1.4
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