RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 VAMP2P63027 116 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 ITPR1Q14643 2758 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPE3 182 aa14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.046e-17■■■□□ 16.2
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ACTB-201ENST00000331789 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.77□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 FAM157CP0CG43 387 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 MMP9P14780 707 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 UQCRFS1P47985 274 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 LYNX1P0DP58 116 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 RAB9BQ9NP90 201 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 P0C879 139 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZNF273Q14593 569 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 RNF141Q8WVD5 230 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 RELNP78509 3460 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 GNLYP22749 145 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 ARV1Q9H2C2 271 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 ITGB1BP1O14713 200 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 SYNGR2O43760 224 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 IAPPP10997 89 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 ABCA4P78363 2273 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 H3BP45 60 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 NDUFB3O43676 98 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 FCGR3BO75015 233 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 RAB7AP51149 207 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 CLINT1Q14677 625 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 HFEQ30201 348 aa14.73□□□□□ -0.05
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