RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 NUDT11Q96G61 164 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 METTL26Q96S19 204 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 C7orf66A4D0T2 115 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 LIPT2A6NK58 231 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CTAG1AP78358 180 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 OR2C3Q8N628 320 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 VAX2Q9UIW0 290 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SNURFLB1AK76 121 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 DHRS3O75911 302 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CXCL2P19875 107 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 OR2V2Q96R30 315 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CORTO00230 105 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PGA3P0DJD8 388 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 BSPH1Q075Z2 132 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 C12orf73Q69YU5 71 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 DTX2Q86UW9 622 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CHST6Q9GZX3 395 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 FAM206AQ9NX38 181 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 THADAQ6YHU6 1953 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 F5H697 171 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CTDSPLO15194 276 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TIMP3P35625 211 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 GLRXP35754 106 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MPV17LQ2QL34 196 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TIMP4Q99727 224 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SLC17A3O00476 420 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CSN3P07498 182 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ERGP11308 486 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CDAP32320 146 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 IER3P46695 156 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ZNF79Q15937 498 aa6.76□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SLC25A22Q9H936 323 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SIP14410 1827 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 HERPUD1Q15011 391 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RAB37Q96AX2 223 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RAB40CQ96S21 281 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RNF2Q99496 336 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PSG11Q9UQ72 335 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.76□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PDE6DO43924 150 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PGA4P0DJD7 388 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PGA5P0DJD9 388 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 NPBWR2P48146 333 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ARF6P62330 175 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 K7N7A8 449 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MGST3O14880 152 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 WNT3P56703 355 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SP6Q3SY56 376 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 DERL1Q9BUN8 251 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ANK1P16157 1881 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 APC2O95996 2303 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 J3QLI3 93 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 UBE2L6O14933 153 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 BCL3P20749 454 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.75□□□□□ -1.33
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