RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Btg2Q04211 158 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcrip1Q3UGS4 97 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gramd2aQ3V3G7 320 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sft2d1Q5SSN7 159 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim12Q78RX3 92 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dirc2Q8BFQ6 478 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mef2cQ8CFN5 474 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r178Q8R2B6 304 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ntng2Q8R4F1 589 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr642Q924X8 314 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab5aQ9CQD1 215 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl18Q9CQL5 180 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spsb1Q9D5L7 273 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 2900055J20RikQ9D6G3 140 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem225Q9D9S2 230 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn15Q9Z0S5 227 aa17.97■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chd8Q09XV5 2582 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxw25F7C9P2 466 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5225J3QPL3 108 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3573L7N292 184 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Siva1O54926 175 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hbb-bh0P04443 147 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp36l2P23949 484 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srp9P49962 86 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psg19Q4KL31 475 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lyrm2Q8R033 88 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thoc3Q8VE80 351 aa17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufa6Q9CQZ5 131 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl13Q9D1P0 178 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prr12E9PYL2 2035 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm14692A2BH01 229 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr554E9Q546 317 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr69E9Q7C5 316 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hprt1P00493 218 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01746 140 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl8P59280 629 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd300lbQ3U497 209 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr6Q6YNI2 363 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1385Q7TQT1 309 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr305Q7TS02 319 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spem2Q8C5U4 503 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Calhm2Q8VEC4 323 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1201Q8VGF5 307 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thyn1Q91YJ3 226 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcts1Q9DB27 181 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ypel1Q9ESC7 118 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Elovl1Q9JLJ5 279 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B3GNT2Q9Z222 397 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav10nA0A075B622 114 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav10A0A075B642 114 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr231E9Q0M4 307 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rdh16f1E9Q9P8 317 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A630023A22RikJ3QP60 199 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ercc1P07903 298 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lsm5P62322 91 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PkibQ04758 92 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zdhhc25Q810M4 279 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8BN57 294 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rdh9Q8K5C8 317 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r235Q8R297 328 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr361Q8VF16 322 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1240Q8VG73 314 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NanpQ9CPT3 248 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sft2d3Q9CSV6 209 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sdf2l1Q9ESP1 221 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rcl1Q9JJT0 373 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gnpnat1Q9JK38 184 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bex3Q9WTZ9 124 aa17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ca6P18761 317 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HexbP20060 536 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CryzP47199 331 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl9P51670 122 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 JPT1P97825 154 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl2l15Q08ED0 167 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prrc1Q3UPH1 443 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q6PIU9 354 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1131Q7TR45 309 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 YbeyQ8CAV0 164 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B4galt7Q8R087 327 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl41Q9CQN7 135 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Armc10Q9D0L7 306 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ergic1Q9DC16 290 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BlnkQ9QUN3 457 aa17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr785A0A0N4SVC3 312 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r129E9QA94 307 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm8720K9J7F4 307 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01795 144 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 H2-LP01897 362 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BlkP16277 499 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SelenohQ3UQA7 116 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pate2Q3UW31 111 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pramel5Q7TPY4 500 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1509Q7TQQ0 308 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fyttd1Q91Z49 317 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tstd3Q9D0B5 157 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sval1Q9D2X6 151 aa17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nova1Q9JKN6 507 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.8 ms