RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sec22aQ8BH47 307 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Aqp6Q8C4A0 293 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr998Q8VF76 314 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr410Q8VFX7 315 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr402Q8VFX8 315 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Osr2Q91ZD1 312 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rab27bQ99P58 218 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Q9CYS6 286 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr122W4VSP0 330 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bdp1Q571C7 2467 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm4175D3YTW8 314 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm9972E9Q053 102 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr555E9Q547 315 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm14288E9Q9W0 88 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r103K7N6X7 305 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r122K7N726 305 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r151L7N288 305 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gpr27O54897 379 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rdh16O54909 317 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd46O88174 365 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 GzmaP11032 260 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rps16P14131 146 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gnb4P29387 340 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gnb1P62874 340 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 PtafrQ62035 341 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ifna14Q810G3 189 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cbln4Q8BME9 198 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gpr137bQ8BNQ3 385 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 YbeyQ8CAV0 164 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rab11fip5Q8R361 645 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Commd5Q8R395 224 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1388Q8VFA3 311 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fbxl6Q9QXW0 535 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 EdarQ9R187 448 aa6.65□□□□□ -1.34
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1109A2AT96 312 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm15446D3Z5Y8 553 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm21783J3QM57 227 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8660K7N6J2 305 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rasl12Q08AT1 266 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rph3alQ768S4 302 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr479Q7TRV1 327 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc25a16Q8C0K5 332 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rae1Q8C570 368 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1457Q8VFK3 317 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc25a37Q920G8 338 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sytl3Q99N48 607 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 MrnipQ9D1F5 335 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 ManbalQ9D8X0 85 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr959Q9EQ86 311 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Syt11Q9R0N3 430 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 TapbpQ9R233 465 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm5239D3YYZ2 122 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Prr23a1G3UW32 258 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm21788J3QNH3 180 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lin7cO88952 197 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ppp1cbP62141 327 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rpusd3Q14AI6 344 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1216Q7TR05 311 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc6a8Q8VBW1 640 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Clec14aQ8VCP9 459 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr368Q8VF22 327 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr24Q8VFM9 313 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc7a12Q8VIE6 465 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 SmagpQ99KC7 97 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tm7sf3Q9CRG1 565 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 4930412O13RikQ9D5M9 106 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r47Q9EQ51 310 aa6.65□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm17655A0A1B0GT13 591 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dhrs3O88876 302 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Serf1O88892 62 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Elk1P41969 429 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plp1P60202 277 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fzd8Q61091 685 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc22a13Q6A4L0 551 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tas2r114Q7M722 309 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1286Q7TQY2 305 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mettl27Q8BGM4 238 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp947Q8BIQ6 437 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Peli1Q8C669 418 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr493Q8VEW5 314 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr50Q8VGK5 312 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gjc3Q921C1 269 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fkbp11Q9D1M7 201 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Q9DAA3 117 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1532-ps1A0A0R4J8U2 307 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rhox7bA6PW38 321 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Kcnk15B2RVL1 343 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rnf217D3YYI7 515 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 CatsperdE9Q9F6 805 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr707K7N662 307 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gfra3O35118 397 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc25a17O70579 307 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 PmchP56942 165 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Atf1P81269 269 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Neil2Q6R2P8 329 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr890Q7TRD9 314 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tctn1Q8BZ64 593 aa6.64□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cypt1Q8CH20 168 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.2 ms