RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr746E9Q840 314 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm6665F6Y363 85 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 H2al1oL7MU04 110 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adgrg5Q3V3Z3 524 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 PnlipQ6P8U6 465 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tas2r116Q7M713 305 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Acsm5Q8BGA8 578 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bricd5Q8BV89 174 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 RhofQ8BYP3 211 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrtm1Q8K377 522 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r74Q8R290 304 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930503E14RikQ9D583 177 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hils1Q9QYL0 170 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ntn3Q9R1A3 580 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 DscamQ9ERC8 2013 aa13.59□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ep300B2RWS6 2412 aa13.58□□□□□ -0.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr548-ps1A0A1B0GSG0 314 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm36368A0A1D5RLK8 91 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4181E9Q7X3 184 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm21788J3QNH3 180 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm17026K7N6Z0 213 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ifna9P09235 190 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 SellP18337 372 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 PvalbP32848 110 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem231Q3U284 315 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 GcdhQ60759 438 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 N6amt1Q6SKR2 214 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Esco2Q8CIB9 592 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 MavsQ8VCF0 503 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr281Q8VET6 311 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1270Q8VGP3 304 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wasf3Q8VHI6 501 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wdr13Q91V09 485 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atg5Q99J83 275 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep41Q99NF3 373 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Il36bQ9D6Z6 183 aa13.58□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sirpb1bA0A0A6YXN8 397 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 FggyA2AJL3 552 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Birc7A2AWP0 285 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4950D3YUM8 205 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp961E9Q4R5 444 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm21818J3KMS6 170 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sirpb1cK7N6K7 397 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm7970L7N271 213 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm7980L7N471 213 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 H3f3cP02301 136 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wnt2P21552 360 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Evx1P23683 416 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdkn1bP46414 197 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 StomP54116 284 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 NrgnP60761 78 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm10645Q3UPY1 145 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 N4bp2l1Q3V2Q8 238 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gp49aQ61450 303 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 TMEM229BQ8BFQ2 167 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 PirtQ8BFY0 135 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Actbl2Q8BFZ3 376 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc25a22Q9D6M3 323 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ceacam18Q9D871 376 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tprg1lQ9DBS2 266 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Foxj2Q9ES18 565 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 SclyQ9JLI6 432 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 SpdefQ9WTP3 325 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Egr4Q9WUF2 478 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 TpbgQ9Z0L0 426 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rd3lB2RV38 197 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r124D3YTX4 307 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm20918J3QN17 227 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccr6O54689 367 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 P01660 111 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Asgr2P24721 301 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tacr3P47937 452 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tas2r41P59532 308 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rras2P62071 204 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rab3cP62823 227 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Anxa7Q07076 463 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm12253Q5NC48 229 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zic3Q62521 466 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 EpopQ7TNS8 369 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tm2d3Q8BJ83 261 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr992Q8VGC6 309 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 DapQ91XC8 102 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp61Q923D1 555 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700029P11RikQ9CQ68 150 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrps36Q9CQX8 102 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mansc1Q9CR33 414 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q9DAZ5 108 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Crim1Q9JLL0 1037 aa13.57□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myo9bQ9QY06 2114 aa13.56□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv1-13A0A075B5I0 98 aa13.56□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcdhgb8A0A140LI48 931 aa13.56□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nxpe5E0CX47 564 aa13.56□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr224M9MMJ7 314 aa13.56□□□□□ -0.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Col8a2P25318 699 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms