Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Tacr3P47937 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tacr3P47937 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tacr3P47937 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tacr3P47937 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tacr3P47937 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tacr3P47937 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tacr3P47937 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tacr3P47937 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tacr3P47937 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tacr3P47937 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tacr3P47937 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tacr3P47937 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tacr3P47937 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tacr3P47937 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tacr3P47937 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tacr3P47937 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tacr3P47937 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tacr3P47937 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tacr3P47937 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tacr3P47937 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tacr3P47937 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tacr3P47937 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tacr3P47937 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tacr3P47937 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tacr3P47937 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tacr3P47937 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tacr3P47937 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tacr3P47937 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tacr3P47937 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tacr3P47937 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tacr3P47937 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tacr3P47937 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tacr3P47937 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tacr3P47937 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tacr3P47937 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tacr3P47937 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tacr3P47937 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tacr3P47937 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tacr3P47937 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tacr3P47937 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tacr3P47937 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tacr3P47937 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tacr3P47937 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tacr3P47937 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tacr3P47937 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tacr3P47937 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tacr3P47937 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tacr3P47937 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tacr3P47937 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tacr3P47937 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tacr3P47937 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tacr3P47937 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tacr3P47937 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tacr3P47937 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tacr3P47937 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tacr3P47937 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tacr3P47937 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tacr3P47937 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tacr3P47937 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tacr3P47937 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tacr3P47937 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tacr3P47937 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tacr3P47937 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tacr3P47937 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tacr3P47937 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tacr3P47937 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tacr3P47937 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tacr3P47937 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tacr3P47937 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tacr3P47937 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tacr3P47937 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tacr3P47937 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tacr3P47937 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tacr3P47937 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tacr3P47937 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tacr3P47937 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tacr3P47937 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tacr3P47937 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tacr3P47937 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tacr3P47937 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tacr3P47937 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tacr3P47937 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tacr3P47937 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tacr3P47937 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tacr3P47937 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tacr3P47937 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tacr3P47937 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tacr3P47937 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tacr3P47937 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tacr3P47937 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tacr3P47937 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tacr3P47937 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tacr3P47937 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tacr3P47937 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tacr3P47937 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tacr3P47937 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tacr3P47937 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tacr3P47937 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tacr3P47937 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms