Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gm7980L7N471 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm7980L7N471 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm7980L7N471 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7980L7N471 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm7980L7N471 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm7980L7N471 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm7980L7N471 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm7980L7N471 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm7980L7N471 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm7980L7N471 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm7980L7N471 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm7980L7N471 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm7980L7N471 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm7980L7N471 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm7980L7N471 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm7980L7N471 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm7980L7N471 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm7980L7N471 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm7980L7N471 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm7980L7N471 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm7980L7N471 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm7980L7N471 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm7980L7N471 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm7980L7N471 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm7980L7N471 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm7980L7N471 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm7980L7N471 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm7980L7N471 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm7980L7N471 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm7980L7N471 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm7980L7N471 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm7980L7N471 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm7980L7N471 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm7980L7N471 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm7980L7N471 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm7980L7N471 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm7980L7N471 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm7980L7N471 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm7980L7N471 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm7980L7N471 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm7980L7N471 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm7980L7N471 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm7980L7N471 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm7980L7N471 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm7980L7N471 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm7980L7N471 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm7980L7N471 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm7980L7N471 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm7980L7N471 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm7980L7N471 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm7980L7N471 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm7980L7N471 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm7980L7N471 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm7980L7N471 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm7980L7N471 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm7980L7N471 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm7980L7N471 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm7980L7N471 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm7980L7N471 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm7980L7N471 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm7980L7N471 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7980L7N471 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7980L7N471 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7980L7N471 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm7980L7N471 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm7980L7N471 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm7980L7N471 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm7980L7N471 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm7980L7N471 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm7980L7N471 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm7980L7N471 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm7980L7N471 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm7980L7N471 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm7980L7N471 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm7980L7N471 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7980L7N471 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm7980L7N471 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm7980L7N471 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7980L7N471 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7980L7N471 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7980L7N471 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7980L7N471 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7980L7N471 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7980L7N471 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7980L7N471 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7980L7N471 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm7980L7N471 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm7980L7N471 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7980L7N471 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7980L7N471 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7980L7N471 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7980L7N471 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7980L7N471 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7980L7N471 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7980L7N471 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7980L7N471 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm7980L7N471 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm7980L7N471 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm7980L7N471 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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