RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ORM1	P02763	201 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD6P3	P58550	94 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FABP5	Q01469	135 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ASAH1	Q13510	395 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NSDHL	Q15738	373 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	XKRX	Q6PP77	449 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF649	Q9BS31	505 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC32	Q9BV29	185 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMED9	Q9BVK6	235 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCB9	Q9NP78	766 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CALY	Q9NYX4	217 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		V9GY05	133 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ACACB	O00763	2458 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KALRN	O60229	2985 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NIZ1	184 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		H7C2Y5	167 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		J3QLW9	94 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF16	O43320	207 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC16A7	O60669	478 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PTTG1	O95997	202 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	REN	P00797	406 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA6	P05013	189 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLL1	P15814	213 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GNB3	P16520	340 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF19	P17023	458 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	VDAC1	P21796	283 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	F8A1	P23610	371 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CD79B	P40259	229 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	APOC4	P55056	127 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R43	P59537	309 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RAP1B	P61224	184 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PON3	Q15166	354 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAM1	Q15629	374 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NNAT	Q16517	81 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CNIH2	Q6PI25	160 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	STX12	Q86Y82	276 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB43	Q86YS6	212 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4K13	Q8NH42	304 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5W2	Q8NH69	310 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CT55	Q8WUE5	264 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TBX5	Q99593	518 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGF2R	P11717	2491 aa		3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRN3	E7EW58	273 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CDIPT	O14735	213 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	UTS2	O95399	124 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGF2	P01344	180 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CLPS	P04118	112 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV3-11	P04433	115 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB5A	P20339	215 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DS4	P43632	304 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RND2	P52198	227 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CAV3	P56539	151 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR12D2	P58182	307 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	AP3S2	P59780	193 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP3R1	P63098	170 aa		3.84	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms